RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 STHQ8IWL8 128 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 TEX26Q8N6G2 289 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 TRIM58Q8NG06 486 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CASP10Q92851 521 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 TMEM186Q96B77 213 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.07□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PIGVQ9NUD9 493 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 TCF19Q9Y242 345 aa5.07□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 A0A087WZ39 114 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 SKILP12757 684 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 KCNK10P57789 538 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 SPHARQ15513 63 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 LACC1Q8IV20 430 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ELMOD1Q8N336 334 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 TRPV3Q8NET8 790 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 OMA1Q96E52 524 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PIGQQ9BRB3 760 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 FUCA2Q9BTY2 467 aa5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 KRT23Q9C075 422 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ETV7Q9Y603 341 aa5.06□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 MLNRO43193 412 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 EPOP01588 193 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CD48P09326 243 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ODC1P11926 461 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ETS1P14921 441 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CHRNB4P30926 498 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 SFNP31947 248 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 MAP2K2P36507 400 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 SRP54P61011 504 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CNTN1Q12860 1018 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-211ENST00000487558 A0A087WW49 117 aa5.04□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 CFAP73A6NFT4 308 aa5.04□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CUL3-211ENST00000487558 SSX5O60225 188 aa5.04□□□□□ -1.6
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