RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 IFT88Q13099 833 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 DEPDC1Q5TB30 811 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 CDYL2Q8N8U2 506 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 TLCD1Q96CP7 247 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 CATSPER2Q96P56 530 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 PRDM7Q9NQW5 492 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 PSD3Q9NYI0 1048 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 PPT2Q9UMR5 302 aa31.09■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 CHST10O43529 356 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 ESRRBO95718 433 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 OTX2P32243 289 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 ASPHQ12797 758 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 MPP2Q14168 576 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 RAB43Q86YS6 212 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 PEX11GQ96HA9 241 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 KCNC2Q96PR1 638 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 CRB3Q9BUF7 120 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 ELOVL6Q9H5J4 265 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 MID1IP1Q9NPA3 183 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 LHX6Q9UPM6 363 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 POLHQ9Y253 713 aa31.08■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 TM9SF1O15321 606 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 JRKO75564 520 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 ETHE1O95571 254 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 THAP4Q8WY91 577 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 SLC29A3Q9BZD2 475 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 KCNK9Q9NPC2 374 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 SNX6Q9UNH7 406 aa31.07■■■□□ 2.57
CHKB-210ENST00000484266 SCN2AQ99250 2005 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 A0A088AWK7 358 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SAP18O00422 153 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 BPGMP07738 259 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 DEFB109BQ30KR1 87 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TBCDQ9BTW9 1192 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SEMA3GQ9NS98 782 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 C3orf18Q9UK00 162 aa31.07■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 RTCAO00442 366 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ZWINTO95229 277 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ENO1P06733 434 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
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CHKB-210ENST00000484266 CERS1P27544 350 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 EFNA3P52797 238 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 MTTPP55157 894 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 CUL3Q13618 768 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 RUNX2Q13950 521 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SGO1Q5FBB7 561 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ZNF793Q6ZN11 406 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 MRGPREQ86SM8 312 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 CA13Q8N1Q1 262 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 METTL6Q8TCB7 284 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 OR1F2PQ96R84 312 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 KCNA7Q96RP8 456 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SERINC2Q96SA4 455 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
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CHKB-210ENST00000484266 VIPAS39Q9H9C1 493 aa31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 IDSB3KWA1 339 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 B3GALT2O43825 422 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 PDYNP01213 254 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ITGB2P05107 769 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SERPINB4P48594 390 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SELENOMQ8WWX9 145 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 CNDP1Q96KN2 507 aa31.05■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 CENPKQ9BS16 269 aa31.05■■■□□ 2.56
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CHKB-210ENST00000484266 NBEAQ8NFP9 2946 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 H3BQF6 201 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 MANBAO00462 879 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 PLPP1O14494 284 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SCELO95171 688 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 DHRS4L1P0CG22 281 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 IL10P22301 178 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 HMOX2P30519 316 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 RAP1GDS1P52306 607 aa31.04■■■□□ 2.56
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CHKB-210ENST00000484266 TTC9Q92623 222 aa31.04■■■□□ 2.56
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CHKB-210ENST00000484266 ARL8AQ96BM9 186 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TBC1D20Q96BZ9 403 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 PKNOX2Q96KN3 472 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 SERPINI1Q99574 410 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TRMOQ9BU70 441 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 ROGDIQ9GZN7 287 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 LANCL2Q9NS86 450 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa31.04■■■□□ 2.56
CHKB-210ENST00000484266 TIMM22Q9Y584 194 aa31.04■■■□□ 2.56
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