RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LANCL2Q9NS86 450 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LRFN1Q9P244 771 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 COPG2Q9UBF2 871 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OARD1Q9Y530 152 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CENPEQ02224 2701 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GTF3C1Q12789 2109 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 A0A088AWK7 358 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM187AA6NFU0 413 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN4O14493 209 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KRT38O76015 456 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MLYCDO95822 493 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINA6P08185 405 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ABOP16442 354 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IL10P22301 178 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CERS1P27544 350 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MSH2P43246 934 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CYB561P49447 251 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HNMTP50135 292 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A5Q01650 507 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IRF8Q02556 426 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 BMPR2Q13873 1038 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TGFBIQ15582 683 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR4D1Q15615 310 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PDK4Q16654 411 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CA13Q8N1Q1 262 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF592Q92610 1267 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CPNE1Q99829 537 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC77Q9BR77 488 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DERL2Q9GZP9 239 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ALG9Q9H6U8 611 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MMP25Q9NPA2 562 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 WHRNQ9P202 907 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RNF14Q9UBS8 474 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TINAGQ9UJW2 476 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQ72 361 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ESYT3A0FGR9 886 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C4orf51C9J302 202 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 E7ESA3 106 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FCHO1O14526 889 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TAPBPO15533 448 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC19A2O60779 497 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STK16O75716 305 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A12O75746 678 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 WISP2O76076 250 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PDE9AO76083 593 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SP1P08047 785 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CYC1P08574 325 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R1BP30154 601 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GP5P40197 560 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA4P43358 317 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GPR85P60893 370 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RAB10P61026 200 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HSF1Q00613 529 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ID2Q02363 134 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TGM3Q08188 693 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STX4Q12846 297 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CHIT1Q13231 466 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RUNX2Q13950 521 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DOC2AQ14183 400 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 10.7
CTPS1-209ENST00000480420 TRADDQ15628 312 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 INAQ16352 499 aa7.56□□□□□ -1.2
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