RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDK2	Q58EX2	2172 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402		H0YIG0	161 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC28A1	O00337	649 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RGS14	O43566	566 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GALT2	O43825	422 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GBA	P04062	536 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGAX	P20702	1163 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTTP	P55157	894 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP7	Q14244	749 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DTX1	Q86Y01	620 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CROT	Q9UKG9	612 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPT2	Q9UMR5	302 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB6	O75190	326 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP6AP2	O75787	350 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLK1	P06870	262 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CERS1	P27544	350 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DLST	P36957	453 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAT5A	P42229	794 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OCA2	Q04671	838 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSG2	Q14126	1118 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR6A1	Q15406	480 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	AMER3	Q8N944	861 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CT55	Q8WUE5	264 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUF2	Q9BZD4	464 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHST10	O43529	356 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEC22B	O75396	215 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	EED	O75530	441 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEMA3D	O95025	777 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	BSG	P35613	385 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GYS2	P54840	703 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALNTL6	Q49A17	601 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWA2	Q5GFL6	755 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	COX15	Q7KZN9	410 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	VASH2	Q86V25	355 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUDT13	Q86X67	352 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C19orf60	Q96EN9	201 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	APIP	Q96GX9	242 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	QRFPR	Q96P65	431 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCT7	Q99832	543 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTSF	Q9UBX1	484 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAO1	Q9UJM8	370 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		12.96	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms