RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 LAPTM4AQ15012 233 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF385BQ569K4 471 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GALNT10Q86SR1 603 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PPCDCQ96CD2 204 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 VEGFDO43915 354 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 KRT75O95678 551 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 MT-ND2P03891 347 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FOSL2P15408 326 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 RRM2P31350 389 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GGT2P36268 569 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 HBA1P69905 142 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 KCNC4Q03721 635 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DGUOKQ16854 277 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GPR156Q8NFN8 814 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FOXJ1Q92949 421 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ICKQ9UPZ9 632 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 VCANP13611 3396 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF11BO00300 401 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SPINT1O43278 529 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ADH5P11766 374 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ACADLP28330 430 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 MASP1P48740 699 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 MLLT10P55197 1068 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NR1D2Q14995 579 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OR2L2Q8NH16 312 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NUS1Q96E22 293 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PCM1Q15154 2024 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TBX19O60806 448 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ADH1CP00326 375 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CYP17A1P05093 508 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 KRT20P35900 424 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CRATP43155 626 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 HMGA2P52926 109 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 RPA4Q13156 261 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LCTLQ6UWM7 567 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 M0R3G1 203 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGA12O60330 932 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 NTRK1P04629 796 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 SCARB2Q14108 478 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 RGS21Q2M5E4 152 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 MTG2Q9H4K7 406 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 AKIP1Q9NQ31 210 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 FKBP14Q9NWM8 211 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 AHSPQ9NZD4 102 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 OR2A25A4D2G3 310 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB3O15480 346 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 C2orf80Q0P641 193 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 P3H2Q8IVL5 708 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 APH1BQ8WW43 257 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 ING5Q8WYH8 240 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 MYDGFQ969H8 173 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 MAL2Q969L2 176 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 SEMA3DO95025 777 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-205ENST00000409985 C6orf47O95873 294 aa22.75■■□□□ 1.23
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