RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR5K3A6NET4 321 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ADAM12O43184 909 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 RFPL3O75679 317 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PPM1BO75688 479 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SCELO95171 688 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DEFA5Q01523 94 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PPA2Q9H2U2 334 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 C5orf42Q9H799 3197 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 FAM227AF5H4B4 570 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 NIPSNAP2O75323 286 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 UROSP10746 265 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PEPDP12955 493 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CBX5P45973 191 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 AVPR1BP47901 424 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ETV1P50549 477 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GEMP55040 296 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DCDC1P59894 354 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 FAM26DQ5JW98 314 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SLC5A8Q8N695 610 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 NELL1Q92832 810 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 C12orf57Q99622 126 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TCF25Q9BQ70 676 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GLUD1P00367 558 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ACRP10323 421 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ITGAMP11215 1152 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SDC2P34741 201 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 HSPA7P48741 367 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CTAG1AP78358 180 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SNX20Q7Z614 316 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CHPFQ8IZ52 775 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OSER1Q9NX31 292 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.77□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 M0QZQ0 153 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PRKAR1AP10644 381 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 B2MP61769 119 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PTPRNQ16849 979 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF566Q969W8 418 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SGTBQ96EQ0 304 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF599Q96NL3 588 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ATG13O75143 517 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 EOMESO95936 686 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TPMTP51580 245 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CTBP2P56545 445 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SSX1Q16384 188 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FCGR1BQ92637 280 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 HPGDSO60760 199 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms