RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356462.10

NEDD4L-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4L, Length 3,335 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-202ENST00000356462 TRIM73Q86UV7 250 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SPARTQ8N0X7 666 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OTULINQ96BN8 352 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 COQ10AQ96MF6 247 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 REEP4Q9H6H4 257 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 EPOPA6NHQ4 379 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ITGB7P26010 798 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.069e-8■■■■■ 192.2
NEDD4L-202ENST00000356462 ALDH3B2P48448 385 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PTPN5P54829 565 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MPEG1Q2M385 716 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 DEFB119Q8N690 84 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SLC5A8Q8N695 610 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OR8K5Q8NH50 307 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CD320Q9NPF0 282 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 IRAK3Q9Y616 596 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 A0A1W2PQU0 124 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PCDH17O14917 1159 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 AP2A2O94973 939 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 HOXC5Q00444 222 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 DUSP7Q16829 419 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 TESCQ96BS2 214 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 KRBA1A5PL33 1030 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 H3BN98 237 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 BCL10O95999 233 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CST6Q15828 149 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CYP2A13Q16696 494 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OR56A3Q8NH54 315 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 NRBF2Q96F24 287 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 KLHL31Q9H511 634 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 RAD18Q9NS91 495 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 NTN1O95631 604 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CAPNS1P04632 268 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 EPHA5P54756 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OLR1P78380 273 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.063e-7■■■□□ 16.7
NEDD4L-202ENST00000356462 CDK6Q00534 326 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CDK5R2Q13319 367 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ITGADQ13349 1161 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CARTPTQ16568 116 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PNCKQ6P2M8 343 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 PLPP1O14494 284 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MT-ND2P03891 347 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CCNA2P20248 432 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 OPRD1P41143 372 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 RORBQ92753 470 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MYADMQ96S97 322 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD4L-202ENST00000356462 SMIM30A4D0T7 59 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 POM121BA6NF01 834 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 HLCSP50747 726 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 NCS1P62166 190 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 SPCS2Q15005 226 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 IRF4Q15306 451 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 HCN2Q9UL51 889 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 H0YIV9 168 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 H0YJX3 145 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 PI15O43692 258 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 BMP10O95393 424 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4L-202ENST00000356462 HTR1AP08908 422 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms