RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DgkaO88673 730 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TrhrP21761 393 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Brcc3P46737 291 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GlrbP48168 496 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rab10P61027 200 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CbfbQ08024 187 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LipnQ3U4B4 400 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clca4bQ3UW98 925 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Plk5Q4FZD7 595 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr331Q5NC44 324 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm11487Q5RIS0 354 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc34a1Q60825 637 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Snta1Q61234 503 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptp4a1Q63739 173 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Maml1Q6T264 1020 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr533Q7TRT7 320 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SetmarQ80UJ9 309 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zcchc4Q8BKW4 512 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptges2Q8BWM0 384 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ankmy1Q8C0W1 906 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aimp2Q8R010 320 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nle1Q8VEJ4 485 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AadacQ99PG0 398 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FopnlQ9CZS3 174 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc167Q9D162 97 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spata9Q9D9R3 252 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc107Q9DCC3 242 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Doc2gQ9ESN1 387 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Egfl7Q9QXT5 275 aa8.97□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm28897A0A087WP44 222 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spaca5A2AE20 160 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm13102A2ASJ3 519 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm7073E9QAS1 335 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SrcP05480 541 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Muc13P19467 573 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Asgr1P34927 284 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 InmtP40936 264 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc11a2P49282 568 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atxn1P54254 791 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mmp20P57748 482 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sox10Q04888 466 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 YdjcQ14BV6 310 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pgap1Q3UUQ7 922 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LpoQ5SW46 710 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lcn12Q6JVL5 193 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssx9Q6XAS3 170 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ubfd1Q78JW9 368 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ankrd45Q810N6 248 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ubp1Q811S7 540 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Akr1c18Q8K023 323 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Grhl2Q8K5C0 625 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FevQ8QZW2 237 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Angptl6Q8R0Z6 457 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bst2Q8R2Q8 172 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcdhb2Q91Y00 799 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dpy30Q99LT0 99 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ykt6Q9CQW1 198 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BambiQ9D0L6 260 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DtnaQ9D2N4 746 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lurap1Q9D6I9 239 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alg5Q9DB25 324 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 9530002B09RikQ9EPV7 135 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sp6Q9ESX2 376 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hacl1Q9QXE0 581 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stub1Q9WUD1 304 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mettl1Q9Z120 268 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa8.96□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trav5-4A0A075B652 114 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 A26c2A0A140LHE4 291 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ttc39aA2ACP1 578 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr231E9Q0M4 307 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3893E9Q1I1 302 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r53L7N473 806 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Il6P08505 211 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LplP11152 474 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tcte3P11985 191 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgap1Q5FWK3 439 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Abcd2Q61285 741 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1057Q7TR75 315 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bdh1Q80XN0 343 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rtp2Q80ZI2 223 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NrrosQ8BMT4 693 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pgm5Q8BZF8 567 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ipo13Q8K0C1 963 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CtbsQ8R242 366 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1426Q8VG74 311 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rbm39Q8VH51 530 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GhitmQ91VC9 346 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scpep1Q920A5 452 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nkd1Q99MH6 471 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Robo3Q9Z2I4 1366 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm13078A2AGW8 474 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.2 ms