RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr653E9PVA0 317 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r25H3BLP0 302 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Suv39h1O54864 412 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpine1P22777 402 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epb42P49222 691 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sox3P53784 375 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rras2P62071 204 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fads2p1Q0VAX3 487 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata13Q5DU57 656 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PtprnQ60673 979 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp1b1Q64429 543 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Paqr3Q6TCG8 311 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med26Q7TN02 588 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prr14Q7TPN9 612 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps4aQ8VEJ9 437 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc41a3Q921R8 488 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx11Q9D3G5 287 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9DAY5 185 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco2a1Q9EPT5 643 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FancgQ9EQR6 623 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btnl10Q9JK39 275 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpini2Q9JK88 405 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mapk11Q9WUI1 364 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r77E9PY60 306 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r14H3BJ46 303 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mup4P11590 178 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdc42P60766 191 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ica1P97411 478 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MedagQ14BA6 303 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mon1bQ8BMQ8 553 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 KptnQ8VCX6 430 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MiosQ8VE19 875 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr589Q8VGV8 317 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrif1Q923B3 828 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ube2fQ9CY34 185 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Actl11Q9D5V1 1207 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp84Q9D654 559 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ItpaQ9D892 198 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxl12Q9EPX5 326 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan3Q9QY33 253 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa9.58□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1032A2ATE5 310 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Izumo4D3Z690 227 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PtprhE9Q0N2 971 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7073E9QAS1 335 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nsmce4aG3XA30 381 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shisa8J3QNX5 399 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r10K7N621 847 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Angpt1O08538 498 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ThP24529 498 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc11a2P49282 568 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cxcl5P50228 132 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxb13P70321 286 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh12Q5RJH3 794 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp943Q6NZP4 507 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Inppl1Q6P549 1257 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam126aQ6P9N1 521 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a12Q8BH59 677 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam92aQ8BP22 355 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bpifb2Q8C1E1 462 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem200aQ8C817 491 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb26Q8C8S0 451 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SntnQ8C9X1 147 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8CC96 669 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lipt1Q8VCM4 373 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Asz1Q8VD46 475 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1033Q8VFK5 310 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Twist2Q9D030 160 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P2ry14Q9ESG6 338 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasal1Q9Z268 799 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddi2A2ADY9 399 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam46dB1ATX6 390 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21319F6YNI8 144 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gosr2O35166 212 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj5P48545 419 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mgat3Q10470 538 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cln3Q61124 438 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mon1aQ6PDG8 556 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 N6amt1Q6SKR2 214 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tdpoz3Q717B4 365 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr664Q7TRP5 306 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb9fQ80UK5 377 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BH50 245 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prokr2Q8K458 381 aa9.57□□□□□ -0.88
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Oit3Q8R4V5 546 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms