RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 GID8Q9NWU2 228 aa24.79■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC7A8Q9UHI5 535 aa24.79■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.79■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.79■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0A6YYD5 115 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0G2JN53 185 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC35G6P0C7Q6 338 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 S100A3P33764 101 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 NFYCQ13952 458 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM92BQ6ZTR7 304 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 IKBIPQ70UQ0 350 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM181AQ8N9Y4 354 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 KCT2Q8NC54 265 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 NCSTNQ92542 709 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNC2Q96PR1 638 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PRDM7Q9NQW5 492 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 R4GN57 208 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR179Q6PRD1 2367 aa24.78■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GABRR3A8MPY1 467 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 H0YGG7 62 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 HCRTR1O43613 425 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SIGLEC6O43699 453 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPRSS11DO60235 418 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 NPPAP01160 153 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SYPP08247 313 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 COX7A2P14406 83 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR3DL1P43629 444 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 MTTPP55157 894 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 RGS1Q08116 209 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE7AQ13946 482 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PGS1Q32NB8 556 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB3Q8N7B9 438 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 TGM7Q96PF1 710 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SERHLQ9NQF3 203 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6V1HQ9UI12 483 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 TLCD2A6NGC4 264 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 A8MUI8 341 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 IL3P08700 152 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 HPCAL1P37235 193 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SSR2P43308 183 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK12P53778 367 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 WNT3P56703 355 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GPLD1P80108 840 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 CFHR1Q03591 330 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXM1Q08050 763 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC6Q16204 474 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PIGGQ5H8A4 983 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4F3Q6IEY1 312 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR180Q86V85 440 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 REEP4Q9H6H4 257 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.77■■□□□ 1.56
SCAMP4-210ENST00000588555 SCN2BO60939 215 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 RASSF9O75901 435 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE5AO76074 875 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 B3GALT4O96024 378 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 FURINP09958 794 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMP1P11279 417 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TSFMP43897 325 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MC1RQ01726 317 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC74AQ96AQ1 378 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 COQ8BQ96D53 544 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC12Q96GR4 267 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CD180Q99467 661 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SPAG4Q9NPE6 437 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.76■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.75■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 DUX1O43812 170 aa24.75■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGA12O60330 932 aa24.75■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PNLIPP16233 465 aa24.75■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms