RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580445.5

OGFOD3-208, Transcript of 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OGFOD3, Length 1,274 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3-208ENST00000580445 SERPINA6P08185 405 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CD1DP15813 335 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 GMPRP36959 345 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 BTG2P78543 158 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 OR4D1Q15615 310 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 INAQ16352 499 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ACER2Q5QJU3 275 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CYP4X1Q8N118 509 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PPM1NQ8N819 430 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 M1APQ8TC57 530 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CCT6BQ92526 530 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 EXT2Q93063 718 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ESAMQ96AP7 390 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 MMP25Q9NPA2 562 aa20.11■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 A0A0G2JN53 185 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 TAPBPO15533 448 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PRMT3O60678 531 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PRAMEF2O60811 474 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 GSTA2P09210 222 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 HSPA7P48741 367 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 RAB10P61026 200 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CAV1Q03135 178 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SLMAPQ14BN4 828 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CYS1Q717R9 158 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 NR4A3Q92570 626 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SMIM10Q96HG1 83 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 NPAS2Q99743 824 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CD274Q9NZQ7 290 aa20.1■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 WIPF3A6NGB9 483 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM227AF5H4B4 570 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 MAN1A2O60476 641 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 RASAL1O95294 804 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 MAOAP21397 527 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 MAGEA4P43358 317 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SLC26A5P58743 744 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ATP6V0D1P61421 351 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 BTN3A2P78410 334 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 27.9
OGFOD3-208ENST00000580445 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 KRT78Q8N1N4 520 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CA13Q8N1Q1 262 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SNX31Q8N9S9 440 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ABI3Q9P2A4 366 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 RNF112Q9ULX5 631 aa20.09■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CLGNO14967 610 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 LRRTM2O43300 516 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CLDN1O95832 211 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 TDGF1P3P51864 188 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 KCNK10P57789 538 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 PMP22Q01453 160 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SLC7A5Q01650 507 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 MEP1AQ16819 746 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF766Q5HY98 468 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 GRTP1Q5TC63 336 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 RAPH1Q70E73 1250 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 TTLQ8NG68 377 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 FBF1Q8TES7 1133 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 FAR2Q96K12 515 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.08■□□□□ 0.81
OGFOD3-208ENST00000580445 ESYT3A0FGR9 886 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 A8MUA0 341 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 PRAMEF4O60810 478 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 STK16O75716 305 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 MYBL2P10244 700 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 STX2P32856 288 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 GGT5P36269 586 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 TAS2R50P59544 299 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 TUBA3CQ13748 450 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.07■□□□□ 0.8
OGFOD3-208ENST00000580445 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms