RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 ERGP11308 486 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 PSMA3P25788 255 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 FOXN2P32314 431 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 HSD17B2P37059 387 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 NFKBIBQ15653 356 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 PDSS2Q86YH6 399 aa9.52□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 LACC1Q8IV20 430 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.52□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 ASB15Q8WXK1 588 aa9.52□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.52□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 TAC3Q9UHF0 121 aa9.52□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 NFS1Q9Y697 457 aa9.52□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 G3V3Y1 287 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 NID1P14543 1247 aa9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 ZNF136P52737 540 aa9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 TNK1Q13470 666 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 SPARCL1Q14515 664 aa9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.51□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 H2AFVQ71UI9 128 aa9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.51□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 CTSSP25774 331 aa9.5□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 ABHD13Q7L211 337 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 KRT222Q8N1A0 295 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.5□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 PANX3Q96QZ0 392 aa9.5□□□□□ -0.89
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APH1B-208ENST00000560353 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.5□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 A0A087X1B8 175 aa9.49□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.49□□□□□ -0.89
APH1B-208ENST00000560353 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.49□□□□□ -0.89
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