RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 FBXL20Q96IG2 436 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 WDR92Q96MX6 357 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 COMMD9Q9P000 198 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZNF222Q9UK12 451 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 MED31Q9Y3C7 131 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 FAM170BA6NMN3 283 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 VEGFDO43915 354 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KLHL18O94889 574 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 SLC16A8O95907 504 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TIMP1P01033 207 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CD2P06729 351 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 C8BP07358 591 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ETV4P43268 484 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ALDH3A2P51648 485 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 F2RL3Q96RI0 385 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KCNH6Q9H252 994 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PHF24Q9UPV7 400 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 USP3Q9Y6I4 520 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 H7C0S8 307 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 IL3P08700 152 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 MPC1LP0DKB6 136 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZNF823P16415 610 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KDELR2P33947 212 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 GNALP38405 381 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ST3GAL3Q11203 375 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CST6Q15828 149 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TRIM63Q969Q1 353 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TMEM203Q969S6 136 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TLR4O00206 839 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 MID1O15344 667 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 LINGO3P0C6S8 592 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 JUPP14923 745 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KCNAB2Q13303 367 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 NFE2L1Q14494 772 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 VMACQ2NL98 169 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PHF19Q5T6S3 580 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TOR3AQ9H497 397 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 FZD3Q9NPG1 666 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 MALT1Q9UDY8 824 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 G3V2L1 256 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 SLC16A5O15375 505 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TBX1O43435 398 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PCDHGA12O60330 932 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PTNP21246 168 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 NTSR1P30989 418 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 SLC6A4P31645 630 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ARFIP1P53367 373 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 NRG3P56975 720 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KCNC4Q03721 635 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PKDCCQ504Y2 493 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PDPRQ8NCN5 879 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 UFD1Q92890 307 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 UCK2Q9BZX2 261 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PCTPQ9UKL6 214 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 OR1A2Q9Y585 309 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-201ENST00000537686 C9J4A7 227 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms