RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC189A1A4V9 331 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFSD2BA6NFX1 497 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MVM7 634 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MX80 341 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPAA1O43292 621 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STBD1O95210 358 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RB1P06400 928 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPC1P48995 793 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLDN15P56746 228 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRKG2Q13237 762 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q5W150 140 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR27Q6MZM9 219 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AACSQ86V21 672 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF677Q86XU0 584 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF182Q8N6D2 247 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDILTQ8N807 584 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNRF1Q8ND25 227 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VN1R17PQ8TDU5 208 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TADA1Q96BN2 335 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXPE2Q96DL1 559 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASD1Q96PB1 797 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRRG4Q9BZD6 226 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VCXQ9H320 206 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIME1Q9H400 295 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLKQ9UBT6 870 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBQLN2Q9UHD9 624 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NID2Q14112 1375 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNX3O60493 162 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GJA1P17302 382 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FUT3P21217 361 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HTR1FP30939 366 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FEN1P39748 380 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDH8P55286 799 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCNT7Q6ZNI0 430 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q6ZVQ6 151 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC34Q96HJ3 373 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NMUR2Q9GZQ4 415 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDCBP2Q9H190 292 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMP27Q9H306 513 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MUC13Q9H3R2 512 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUEDC2Q9H467 287 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OPA3Q9H6K4 179 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PREBQ9HCU5 417 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMBNQ9NP70 447 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PPQ1 181 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RRN3P2A6NIE6 340 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYO1GB0I1T2 1018 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLGAP1O14490 977 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIP5K1CO60331 668 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD59P13987 128 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HMGCLP35914 325 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC1A6P48664 564 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCR9P51686 369 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUL3Q13618 768 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRYMQ14894 314 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHST9Q7L1S5 443 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HEATR4Q86WZ0 1026 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESX1Q8N693 406 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIR2DL4Q99706 377 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PINK1Q9BXM7 581 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF11Q9UIL8 331 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO7Q9Y3I1 522 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TENM3Q9P273 2699 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PPK0 400 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCP10L2B9ZVM9 353 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YES1P07947 543 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OAS2P29728 719 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNLIPRP2P54317 469 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP6P55212 293 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTG1P62324 171 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPNMBQ14956 572 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPTX1Q15818 432 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF781Q8N8C0 355 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MARCH1Q8TCQ1 289 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPHS2Q99611 448 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR88Q9GZN0 384 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms