RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493706.1

XRCC5-210, Transcript of X-ray repair cross complementing 5, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC5, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5-210ENST00000493706 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 MINDY3Q9H8M7 445 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 COL18A1P39060 1754 aa3□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 A0A1W2PR80 420 aa2.99□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 F8VVB4 439 aa2.99□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 F8VWA3 439 aa2.99□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 Q6ZRP5 223 aa2.99□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.99□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 TTC27Q6P3X3 843 aa2.98□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 BTBD9Q96Q07 612 aa2.98□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 ASCL2Q99929 193 aa2.98□□□□□ -1.93
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XRCC5-210ENST00000493706 ZWILCHQ9H900 591 aa2.98□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.98□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 KLK4Q9Y5K2 254 aa2.98□□□□□ -1.93
XRCC5-210ENST00000493706 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.98□□□□□ -1.93
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