RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373209.2

PRF1-201, Transcript of perforin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRF1, Length 2,492 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1-201ENST00000373209 CCDC159P0C7I6 412 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 HPCAL1P37235 193 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 GPR1P46091 355 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 C2orf80Q0P641 193 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 RFX4Q33E94 735 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 LZICQ8WZA0 190 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PROX1Q92786 737 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 TIFAQ96CG3 184 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 COQ8BQ96D53 544 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ADH5P11766 374 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 C6P13671 934 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 MYOGP15173 224 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SOAT1P35610 550 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CCR3P51677 355 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CDH12P55289 794 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CAMK1Q14012 370 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CLCA4Q14CN2 919 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SYT16Q17RD7 645 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SPIN4Q56A73 249 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SLC5A8Q8N695 610 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 MAGED4Q96JG8 741 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 COQ10AQ96MF6 247 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 DUSP21Q9H596 190 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 MYO10Q9HD67 2058 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 C9P02748 559 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 STATHP02808 62 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PSMB5P28074 263 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 KEAP1Q14145 624 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FAHD1Q6P587 224 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PGBD3Q8N328 593 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 DOHHQ9BU89 302 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 RAD18Q9NS91 495 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 RNF6Q9Y252 685 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.48□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 M0QX08 132 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 IL3P08700 152 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FURINP09958 794 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PTGER1P34995 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ASMTP46597 345 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PHEXP78562 749 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 IL18R1Q13478 541 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 VEZF1Q14119 521 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 DMC1Q14565 340 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 NLRP8Q86W28 1048 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CCDC103Q8IW40 242 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SETD9Q8NE22 299 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 142.6
PRF1-201ENST00000373209 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 UCN3Q969E3 161 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ZNF566Q969W8 418 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 NUS1Q96E22 293 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 REEP4Q9H6H4 257 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 TNFRSF11BO00300 401 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FUCA1P04066 466 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SELENOWP63302 87 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SPIBQ01892 262 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 APOL4Q9BPW4 351 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.47□□□□□ -0.09
PRF1-201ENST00000373209 ASF1AQ9Y294 204 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms