RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MPP7Q5T2T1 576 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 BBS10Q8TAM1 723 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DPH7Q9BTV6 452 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 LGR4Q9BXB1 951 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR34Q9UPC5 381 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C74A6NCV1 312 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX30O94993 753 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CDKN2DP55273 166 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CD47Q08722 323 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 E2F2Q14209 437 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf22Q49AR2 442 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 USP43Q70EL4 1123 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CASD1Q96PB1 797 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPNQ9BXN1 380 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT52Q9Y366 437 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM25EA8MYX2 175 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PDYNP01213 254 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CD9P21926 228 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DOC2AQ14183 400 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGR1Q14914 329 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PON3Q15166 354 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NPTX1Q15818 432 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 STON2Q8WXE9 905 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCC1Q96S66 551 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IL21RQ9HBE5 538 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FANCFQ9NPI8 374 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 KAT6AQ92794 2004 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MID1O15344 667 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 BCKDHAP12694 445 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAM2Q15035 370 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF12Q96QT6 1004 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA10O75578 1167 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 HEXBP07686 556 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH3A2P51648 485 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.118e-7■■■■□ 22.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf61Q13536 156 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB43Q86YS6 212 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NANOGQ9H9S0 305 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 LIPT1Q9Y234 373 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH1P12882 1939 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf226A1L170 272 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DPPA5A6NC42 116 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3R3Q92569 461 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGKQ92643 395 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RELTQ969Z4 430 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH11P35749 1972 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C5P01031 1676 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IL3P08700 152 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 IVDP26440 423 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF550Q7Z398 422 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB8BQ92930 207 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ8BQ96D53 544 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX5Q99593 518 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PKP2Q99959 881 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPMQ9NSP4 180 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GIN1Q9NXP7 522 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 DFNA5O60443 496 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 ID2Q02363 134 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL26Q53HC5 615 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 NXPE4Q6UWF7 544 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST14Q8NCH0 376 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RMI1Q9H9A7 625 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 AIG1Q9NVV5 245 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms