RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 RETP07949 1114 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 HRH2P25021 359 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 GSK3BP49841 420 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CYS1Q717R9 158 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 EID2Q8N6I1 236 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 UBR1Q8IWV7 1749 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TRBC2A0A5B9 178 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PCDH17O14917 1159 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 AK1P00568 194 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 ARFRP1Q13795 201 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SFXN5Q8TD22 340 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 C10orf90Q96M02 699 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 GPR21Q99679 349 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 A6NHS1 94 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 HTR1EP28566 365 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 IMPA1P29218 277 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RAB31Q13636 194 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ENPP2Q13822 863 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NTRK2Q16620 822 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF597Q96LX8 424 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 DOHHQ9BU89 302 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MRIQ9BWK5 157 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RNF32Q9H0A6 362 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 GAREM1Q9H706 876 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CWH43Q9H720 699 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 EMC7Q9NPA0 242 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KLK14Q9P0G3 267 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 LCHNA4D1U4 455 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SEC14L5O43304 696 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 AOC2O75106 756 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FAM163BP0C2L3 166 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RAB3AP20336 220 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RAP2BP61225 183 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MYH6P13533 1939 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 LRP5LA4QPB2 252 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 A8MT66 165 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TNFRSF10AO00220 468 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 INSIG1O15503 277 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RELAQ04206 551 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RCAN2Q14206 197 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF460Q14592 562 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 AADACL2Q6P093 401 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RAB39BQ96DA2 213 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 HAPLN3Q96S86 360 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ABCG5Q9H222 651 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KRBA1A5PL33 1030 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FAM170BA6NMN3 283 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 H3BRB1 525 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TLR5O60602 858 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 HCKP08631 526 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 INSRRP14616 1297 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CXCR1P25024 350 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 OXTRP30559 389 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MMP12P39900 470 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CEP68Q76N32 757 aa5.34□□□□□ -1.55
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