RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA1P01009 418 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LYNP07948 512 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 F3P13726 295 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 IL9P15248 144 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFS1P28331 727 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ABATP80404 500 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNB3Q05901 458 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PDK3Q15120 406 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 IKBIPQ70UQ0 350 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP90Q8TF47 636 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MIEF1Q9NQG6 463 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 BATF3Q9NR55 127 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OR6C2Q9NZP2 312 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 VPS4AQ9UN37 437 aa21.73■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JN53 185 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC3AO75596 197 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LDLRP01130 860 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NTRK1P04629 796 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RETP07949 1114 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CD6P30203 668 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA13P48723 471 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 AMER3Q8N944 861 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TM4SF18Q96CE8 201 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MTERF3Q96E29 417 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPC1 479 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 H0YJX3 145 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 BTN3A3O00478 584 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ACOX3O15254 700 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GPR37L1O60883 481 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GRK3P35626 688 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G16P53816 162 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 FZD5Q13467 585 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PAGE2Q7Z2X7 111 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PTOV1Q86YD1 416 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 RGMAQ96B86 450 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ABCG4Q9H172 646 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 Q9H521 79 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KLF15Q9UIH9 416 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 DGKBQ9Y6T7 804 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.72■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LRIT2A6NDA9 550 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS11DO60235 418 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TNFP01375 233 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT7P0C024 238 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CMPK1P30085 196 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 ADRM1Q16186 407 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 VMACQ2NL98 169 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CPZQ66K79 652 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MARVELD2Q8N4S9 558 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PATE1Q8WXA2 126 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 VPS50Q96JG6 964 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CNBD2Q96M20 576 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SRMSQ9H3Y6 488 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL31Q9H511 634 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KRBA1A5PL33 1030 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CLOCKO15516 846 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 GK3PQ14409 553 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT13Q86X67 352 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TTLQ8NG68 377 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 C17orf62Q9BQA9 187 aa21.71■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 TOR1BO14657 336 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 DDCP20711 480 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 RGNQ15493 299 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 ZIC1Q15915 447 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SFTPA2Q8IWL1 248 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 FOXQ1Q9C009 403 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 CHST8Q9H2A9 424 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 NTN4Q9HB63 628 aa21.7■■□□□ 1.06
VSTM4-201ENST00000298454 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.7■■□□□ 1.06
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