RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TM9SF2Q99805 663 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SNAP29O95721 258 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 S1PR4O95977 384 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GBAP04062 536 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SCAPQ12770 1279 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 BBS10Q8TAM1 723 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PREBQ9HCU5 417 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC6O95255 1503 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MPC1LP0DKB6 136 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD1P49961 510 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPGP53567 150 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 LAPTM4AQ15012 233 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SETD6Q8TBK2 473 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GSTT2P0CG29 244 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZVL8 140 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF69Q9UC07 566 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GRID2O43424 1007 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA12O60330 932 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GDI1P31150 447 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PREPP48147 710 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DGKEP52429 567 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SPERTQ8NA61 448 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NXPE2Q96DL1 559 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA21P01568 189 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 IFI30P13284 250 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL4Q11206 333 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GRB7Q14451 532 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PTGR1Q14914 329 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RAB39AQ14964 217 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SEC23BQ15437 767 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 COQ5Q5HYK3 327 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CEP97Q8IW35 865 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PROM1O43490 865 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM7Q14002 265 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DOHHQ9BU89 302 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OR51I1Q9H343 314 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SRRDQ9UH36 339 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ELK4P28324 431 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HSD11B1P28845 292 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CD47Q08722 323 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GPM6BQ13491 265 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 UPP1Q16831 310 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF675Q8TD23 568 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SMPDL3BQ92485 455 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM129BQ96TA1 746 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 WACQ9BTA9 647 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQY0 241 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SOD2P04179 222 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OTUB2Q96DC9 234 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MCHR1Q99705 422 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL8Q9H568 366 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MLXQ9UH92 298 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA2P43356 314 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 IST1P53990 364 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GID4Q8IVV7 300 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 IFT52Q9Y366 437 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.4■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 IFT172Q9UG01 1749 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CDKL1Q00532 357 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms