RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SOX9P48436 509 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BCAP31P51572 246 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PRKAG1P54619 331 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CBX3Q13185 183 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 P3H2Q8IVL5 708 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LGALS12Q96DT0 336 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LGR4Q9BXB1 951 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SULT1C4O75897 302 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 KLHL18O94889 574 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C7P10643 843 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.083e-8■□□□□ 10.6
GINS1-201ENST00000262460 DMC1Q14565 340 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF284Q2VY69 593 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LIPIQ6XZB0 460 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ADCK2Q7Z695 626 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LGI4Q8N135 537 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GLYATL1Q969I3 302 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TESCQ96BS2 214 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 KCNK12Q9HB15 430 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 A6NL46 340 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 M0R082 166 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FRS3O43559 492 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 JRKO75564 520 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GPX2P18283 190 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FPR1P21462 350 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CDH3P22223 829 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HOXC5Q00444 222 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MED22Q15528 200 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CBLL1Q75N03 491 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 COMTD1Q86VU5 262 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CADM3Q8N126 398 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LEMD2Q8NC56 503 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ARMC5Q96C12 935 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BTBD2Q9BX70 525 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 USE1Q9NZ43 259 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ASF1AQ9Y294 204 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CLDN25C9JDP6 229 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 H7BY64 318 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC16A6O15403 523 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HPRP00739 348 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CEBPBP17676 345 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 RCVRNP35243 200 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SOX3P41225 446 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MVDP53602 400 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MXD1Q05195 221 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms