RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EnpepP16406 945 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccnb2P30276 398 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt1P53368 156 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CidecP56198 239 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elmod1Q3V1U8 326 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ahi1Q8K3E5 1047 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RbksQ8R1Q9 323 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc24a3Q99PD7 645 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mri1Q9CQT1 369 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Deaf1Q9Z1T5 566 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn8Q9Z260 225 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glyatl3E9Q5L8 290 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clcn7O70496 803 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FpgsP48760 587 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il1rapQ61730 570 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep78Q6IRU7 790 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SgtaQ8BJU0 315 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slitrk6Q8C110 840 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc142Q8CAI1 738 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrg1Q8K209 687 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eml3Q8VC03 897 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spon1Q8VCC9 807 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nkd1Q99MH6 471 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Agpat5Q9D1E8 365 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vsig1Q9D2J4 407 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo8Q9QZN3 319 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Orc6Q9WUJ8 262 aa15.51■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4450E9Q007 373 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp1a1P00184 524 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gon7P0C8B4 98 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde7aP70453 456 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prelid2Q0VBB0 177 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klra2Q60660 288 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sim1Q61045 765 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsd3b4Q61767 373 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8BL95 290 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubr7Q8BU04 425 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps37aQ8CHS8 397 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx19Q8R1Q0 292 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr561Q8VGZ6 314 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fhl5Q9WTX7 284 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh23Q99PF4 3354 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox2bA2A447 191 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox2cA2AWL9 191 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r31L7N2F1 303 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbx2P48031 348 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr2cP97760 275 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sox14Q04892 240 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GiprQ0P543 460 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upf3aQ3ULJ3 422 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Macrod2Q3UYG8 475 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fzd4Q61088 537 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elmod2Q8BGF6 293 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pih1d2Q8CHR9 315 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cbx7Q8VDS3 158 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nphs2Q91X05 385 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr55Q9CX97 388 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx7Q9CY18 387 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pard6gQ9JK84 382 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acot2Q9QYR9 453 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgk2Q9QZS5 367 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spo11Q9WTK8 396 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Padi3Q9Z184 664 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1253A2AUA2 318 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r9A2RST7 299 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col6a2Q02788 1034 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnh6Q32ME0 950 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fis1Q9CQ92 152 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clca3a1Q9QX15 902 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dgat1Q9Z2A7 498 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17190V9GX38 357 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r10W4VSP8 311 aa15.5■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif28pD3YXS5 1028 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gfra2O08842 464 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gosr2O35166 212 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pld3O35405 488 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifngr2Q63953 332 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim45Q6PFY8 580 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C5ar2Q8BW93 344 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cers6Q8C172 384 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dmtf1Q8CE22 761 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Camkk1Q8VBY2 505 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif3mQ99JX4 374 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam24Q9R160 761 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpm7Q923J1 1863 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btnl4A2CG29 586 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankle1A8VU90 534 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tulp3O88413 460 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GzmeP08884 248 aa15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Surf2P09926 257 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emp1P47801 160 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms