RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562903.5

KIFC3-211, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KIFC3, Length 3,221 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-211ENST00000562903 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 RNF121Q9H920 327 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 RLIMQ9NVW2 624 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 KCNN3Q9UGI6 736 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 FABP12A6NFH5 140 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 COCHO43405 550 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 IL1RNP18510 177 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 WEE1P30291 646 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 RORCP51449 518 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CDH12P55289 794 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ITGA1P56199 1179 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF79Q15937 498 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 FUT10Q6P4F1 479 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 C17orf99Q6UX52 265 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF367Q7RTV3 350 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 WFDC5Q8TCV5 224 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SELENOMQ8WWX9 145 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 APOLD1Q96LR9 279 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SLC22A12Q96S37 553 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ATG10Q9H0Y0 220 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 MALT1Q9UDY8 824 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CCL27Q9Y4X3 112 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 V9GYH0 126 aa13.06□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 B4DXG7 233 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 MANBAO00462 879 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TYMPP19971 482 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 RAB25P57735 213 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SPIBQ01892 262 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 HYAL2Q12891 473 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CDH18Q13634 790 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 30.9
KIFC3-211ENST00000562903 CYP27C1Q4G0S4 372 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 NELL1Q92832 810 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CRELD1Q96HD1 420 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 FAM83DQ9H4H8 585 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF556Q9HAH1 456 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 NINQ8N4C6 2090 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SUV39H1O43463 412 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 OR1E2P47887 323 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 BNC1Q01954 994 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 VEPH1Q14D04 833 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CDONQ4KMG0 1287 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PXDC1Q5TGL8 231 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SLC34A3Q8N130 599 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TEX26Q8N6G2 289 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 MAL2Q969L2 176 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 EID2BQ96D98 161 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TTLL2Q9BWV7 592 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 BARHL1Q9BZE3 327 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TRAPPC4Q9Y296 219 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CMAHPQ9Y471 501 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 A0A0C4DFX4 3053 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 B8ZZF3 427 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 WWP2O00308 870 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TSPAN9O75954 239 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 KIR3DL1P43629 444 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 MAPK12P53778 367 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 DSC3Q14574 896 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 IFNL1Q8IU54 200 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 FOXJ1Q92949 421 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PEX13Q92968 403 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 IL4I1Q96RQ9 567 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SRRQ9GZT4 340 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TMEM184CQ9NVA4 438 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.05□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CDK2AP1O14519 115 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 AP2A2O94973 939 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 NUDT7P0C024 238 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TRAPPC2P0DI81 140 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 TRAPPC2BP0DI82 140 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 CYBAP13498 195 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 PTGS2P35354 604 aa13.04□□□□□ -0.32
KIFC3-211ENST00000562903 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms