RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PHF21AQ96BD5 680 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ROPN1LQ96C74 230 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ASB9Q96DX5 294 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SGK2Q9HBY8 427 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf109Q9NX04 203 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TINAGQ9UJW2 476 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLITRK5O94991 958 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CBSLP0DN79 551 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C6P13671 934 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MAPK1P28482 360 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA9P31269 272 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CBSP35520 551 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HNF4AP41235 474 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 METAP1P53582 386 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RUNX3Q13761 415 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 VITQ6UXI7 678 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CADM2Q8N3J6 435 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SFRP1Q8N474 314 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CYGBQ8WWM9 190 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LRCH3Q96II8 777 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ART5Q96L15 291 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PBX4Q9BYU1 374 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BRD7Q9NPI1 651 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SARDHQ9UL12 918 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MOSPD3O75425 235 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 COX7A2P14406 83 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GPX3P22352 226 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SOX9P48436 509 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNB3Q05901 458 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZBED5Q49AG3 693 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TEX19Q8NA77 164 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT8Q8WV74 236 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC120Q96HB5 630 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AIG1Q9NVV5 245 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MYO10Q9HD67 2058 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FAM234BA2RU67 622 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RAB19A4D1S5 217 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HMX3A6NHT5 357 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MANBAO00462 879 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TSC22D2O75157 780 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF682O95780 498 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC16A8O95907 504 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 EBLN1P0CF75 366 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ADRB3P13945 408 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CKMT2P17540 419 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TGM1P22735 817 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DPP6P42658 865 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AP1S2P56377 157 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF846Q147U1 533 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FRG2Q64ET8 278 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF425Q6IV72 752 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LYPD8Q6UX82 237 aa7.57□□□□□ -1.2
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