RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ITSN1	Q15811	1721 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		3.39	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	USP32	Q8NFA0	1604 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GUA9	196 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GLOD5	A6NK44	160 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NXPH4	O95158	308 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LINGO3	P0C6S8	592 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IRF2	P14316	349 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GP9	P14770	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SAT1	P21673	171 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PEX19	P40855	299 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CHAF1B	Q13112	559 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	VEZF1	Q14119	521 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM29	Q14134	588 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SPECC1	Q5M775	1068 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NME8	Q8N427	588 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SKA1	Q96BD8	255 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF597	Q96LX8	424 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MAF1	Q9H063	256 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	VPS28	Q9UK41	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CHKB	Q9Y259	395 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EVC2	Q86UK5	1308 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PTGES	O14684	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN9	O75954	239 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC175	P0C221	793 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SKIL	P12757	684 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SELE	P16581	610 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	HSPA1L	P34931	641 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GCK	P35557	465 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRPH	P41219	470 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CLDN15	P56746	228 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TMED1	Q13445	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MEA1	Q16626	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	HHAT	Q5VTY9	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	OR4A47	Q6IF82	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	APPL2	Q8NEU8	664 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NEK11	Q8NG66	645 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PIK3R3	Q92569	461 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PDE7B	Q9NP56	450 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TNR	Q92752	1358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		3.37	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PTPRM	P28827	1452 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	AKAP12	Q02952	1782 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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