RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 ADRA1DP25100 572 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 IVDP26440 423 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 ACTR1BP42025 376 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 BLKP51451 505 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 DCDC1P59894 354 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ACTR1AP61163 376 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 B4GALNT1Q00973 533 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 KCNAB1Q14722 419 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 TPSAB1Q15661 275 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FAM153CQ494X1 144 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 R3HDM4Q96D70 268 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SERPINB12Q96P63 405 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 OR2M4Q96R27 311 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.24□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CDC23Q9UJX2 597 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PTPRBP23467 1997 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 HEATR9A2RTY3 570 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ZAR1LA6NP61 321 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 CCDC188H7C350 402 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 TNFSF14O43557 240 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 VAPBO95292 243 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 MSH3P20585 1137 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TEAD1P28347 426 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 GABRB3P28472 473 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NPY2RP49146 381 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ACADVLP49748 655 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TIRAPP58753 221 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 NFE2L1Q14494 772 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBE2B-204ENST00000504431 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 C4orf22Q6V702 233 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SNX20Q7Z614 316 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 GKN2Q86XP6 184 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NAGSQ8N159 534 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 STYXQ8WUJ0 223 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PMM1Q92871 262 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TTC25Q96NG3 672 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 VPS35Q96QK1 796 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NRTNQ99748 197 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.23□□□□□ -1.25
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