RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CCT6BQ92526 530 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SERPINA6P08185 405 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KRT15P19012 456 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CASP2P42575 452 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB8AP61006 207 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2H2Q13888 395 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CASP8Q14790 479 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 DEFB134Q4QY38 66 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SH2D5Q6ZV89 423 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZBTB9Q96C00 473 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MESP1Q9BRJ9 268 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CRB3Q9BUF7 120 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TMCO1Q9UM00 188 aa25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 BSNQ9UPA5 3926 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 A8MT66 165 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 STX16O14662 325 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PRB1P04280 392 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ALOX12P18054 663 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDH1Q08174 1060 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 LAPTM5Q13571 262 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HERC3Q15034 1050 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TTLQ8NG68 377 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5T3Q8NGG3 340 aa25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KALRNO60229 2985 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MASP2O00187 686 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJB6O75190 326 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 JRKO75564 520 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 EFNA3P52797 238 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ABHD13Q7L211 337 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 LCA5Q86VQ0 697 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CNPY4Q8N129 248 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 OR51Q1Q8NH59 317 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 IPPKQ9H8X2 491 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 C3orf18Q9UK00 162 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PCTPQ9UKL6 214 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa25.08■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CLEC3AO75596 197 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 GSTA1P08263 222 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SMIM10L1P0DMW3 83 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 MMP11P24347 488 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 GSTM2P28161 218 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 OLR1P78380 273 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNAB2Q13303 367 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 KRT71Q3SY84 523 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 GRHL2Q6ISB3 625 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SMIM10Q96HG1 83 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 TGIF2Q9GZN2 237 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 ING2Q9H160 280 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 RHBGQ9H310 441 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 ZBTB26Q9HCK0 441 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 C14orf105Q9NVL8 296 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 EMCNQ9ULC0 261 aa25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0G2JN53 185 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SOCS6O14544 535 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 OR7A17O14581 309 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 BMP10O95393 424 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 RPS17P08708 135 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 MED27Q6P2C8 311 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF175Q8N4F7 328 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 RBCK1Q9BYM8 510 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 ACTR8Q9H981 624 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSS2Q9NR19 701 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.06■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 LRIT2A6NDA9 550 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 URADA6NGE7 173 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 IDSB3KWA1 339 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 PCNAP12004 261 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 XCR1P46094 333 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 PIK3CGP48736 1102 aa25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GTF3C4-202ENST00000483873 RBBP7Q16576 425 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms