RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PI15O43692 258 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CREG1O75629 220 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 S1PR1P21453 382 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PPM1AP35813 382 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ST3GAL4Q11206 333 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TAAR8Q969N4 342 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 A0A1W2PPW3 197 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PAGE1O75459 146 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MATN4O95460 622 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ITGAMP11215 1152 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 RETREG3Q86VR2 466 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 BIRC7Q96CA5 298 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TOR1AO14656 332 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 ART1P52961 327 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 OGDHQ02218 1023 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 NIPAL3Q6P499 406 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ABCG4Q9H172 646 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KCNH6Q9H252 994 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ICKQ9UPZ9 632 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PRSS44E7EML9 344 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ADAP00813 363 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PPP3CBP16298 524 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RAB4AP20338 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 L1CAMP32004 1257 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CLCN3P51790 818 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 TOMM20Q15388 145 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 E7EQ34 232 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 GOSR2O14653 212 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 HSPB3Q12988 150 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CHIT1Q13231 466 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 IRF4Q15306 451 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ACTBL2Q562R1 376 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 LCN8Q6JVE9 175 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KCTD9Q7L273 389 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ATG4CQ96DT6 458 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KCNC2Q96PR1 638 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 TO15178 435 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CTSEP14091 401 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 IDSP22304 550 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 UQCRC2P22695 453 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 REEP3Q6NUK4 255 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SLC22A25Q6T423 547 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SMARCD2Q92925 531 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 APMAPQ9HDC9 416 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 FBXO10Q9UK96 956 aa5.35□□□□□ -1.55
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