RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RngttO55236 597 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 EnpepP16406 945 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cst3P21460 140 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AhrP30561 848 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gabrb3P63080 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smad4P97471 551 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trafd1Q3UDK1 580 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pdp1Q3UV70 538 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H2-Q2Q4KN81 360 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spin1Q61142 262 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp3a16Q64481 504 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem270Q6UJB9 264 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr670Q7TRP3 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ifnl3Q8CGK6 193 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrc56Q8K375 552 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sbk1Q8QZX0 417 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc29a4Q8R139 528 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tas1r2Q925I4 843 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wdr77Q99J09 342 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4933400A11RikQ9CR52 288 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q9DAQ4 598 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Psma6Q9QUM9 246 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Itgb6Q9Z0T9 787 aa8.99□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf518bB2RRE4 1077 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rhox2gL7MUB9 191 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc16a8O35308 492 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dsg2O55111 1122 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dnmt3bO88509 859 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd1d1P11609 336 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd1d2P11610 336 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc2a4P14142 509 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Etv4P28322 485 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HgfQ08048 728 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam105aQ3TVP5 353 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Srebf2Q3U1N2 1130 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc61Q3UJV1 511 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zswim9Q6DI92 447 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Otop1Q80VM9 600 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgap11aQ80Y19 987 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sgpp2Q810K3 354 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Asb14Q8C6Y6 587 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 St3gal4Q91Y74 333 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 EtfdhQ921G7 616 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bcl7bQ921K9 202 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cables1Q9ESJ1 568 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vnn3Q9QZ25 500 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ChrdQ9Z0E2 948 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5072A2AHM1 344 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mterf1bB9EJ57 379 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm281D3Z1Y0 860 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3526E9PZM0 191 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ceacam3E9Q6J4 706 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mtnd2P03893 345 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acsl1P41216 699 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PuraP42669 321 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 UqcrhP99028 89 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nlrc3Q5DU56 1064 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc10a5Q5PT54 434 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clcn4Q61418 747 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Galk2Q68FH4 458 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sohlh1Q6IUP1 357 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Msantd2Q6NZR2 559 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sort1Q6PHU5 825 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prr5Q812A5 387 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 P2ry10Q8BFU7 328 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc26a9Q8BU91 790 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4922502D21RikQ8C634 189 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PdgfcQ8CI19 345 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr769Q8K501 312 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc35b2Q91ZN5 431 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Retreg3Q9CQV4 466 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Themis3Q9CU24 569 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sppl3Q9CUS9 384 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CrtapQ9CYD3 400 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pus10Q9D3U0 527 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpn3Q9D3W4 284 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tubb3Q9ERD7 450 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Copz2Q9JHH9 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SrrQ9QZX7 339 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nfkb2Q9WTK5 899 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gdf2Q9WV56 428 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21294A0A087WS79 222 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ripor3A1L3T7 938 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rhox2hK7N6P1 191 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r67K7N6T2 851 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3159K7N760 267 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scarb2O35114 478 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Azin1O35484 448 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ntrk2P15209 821 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mep1aP28825 747 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr55Q3UJF0 327 aa8.98□□□□□ -0.97
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Usp22Q5DU02 525 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.8 ms