Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mep1aP28825 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mep1aP28825 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mep1aP28825 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mep1aP28825 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Mep1aP28825 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mep1aP28825 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Mep1aP28825 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mep1aP28825 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mep1aP28825 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mep1aP28825 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mep1aP28825 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mep1aP28825 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mep1aP28825 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mep1aP28825 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mep1aP28825 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mep1aP28825 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mep1aP28825 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mep1aP28825 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mep1aP28825 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mep1aP28825 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mep1aP28825 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mep1aP28825 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mep1aP28825 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mep1aP28825 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mep1aP28825 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mep1aP28825 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mep1aP28825 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mep1aP28825 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mep1aP28825 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mep1aP28825 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Mep1aP28825 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mep1aP28825 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mep1aP28825 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mep1aP28825 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mep1aP28825 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mep1aP28825 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mep1aP28825 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mep1aP28825 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mep1aP28825 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Mep1aP28825 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mep1aP28825 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mep1aP28825 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mep1aP28825 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mep1aP28825 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mep1aP28825 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mep1aP28825 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mep1aP28825 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mep1aP28825 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mep1aP28825 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mep1aP28825 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mep1aP28825 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mep1aP28825 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mep1aP28825 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mep1aP28825 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mep1aP28825 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mep1aP28825 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mep1aP28825 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mep1aP28825 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mep1aP28825 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mep1aP28825 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mep1aP28825 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mep1aP28825 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mep1aP28825 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mep1aP28825 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mep1aP28825 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mep1aP28825 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mep1aP28825 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mep1aP28825 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mep1aP28825 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mep1aP28825 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mep1aP28825 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mep1aP28825 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mep1aP28825 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mep1aP28825 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mep1aP28825 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mep1aP28825 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mep1aP28825 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mep1aP28825 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mep1aP28825 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mep1aP28825 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mep1aP28825 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mep1aP28825 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mep1aP28825 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mep1aP28825 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mep1aP28825 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mep1aP28825 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mep1aP28825 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mep1aP28825 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mep1aP28825 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mep1aP28825 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mep1aP28825 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mep1aP28825 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mep1aP28825 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mep1aP28825 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mep1aP28825 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mep1aP28825 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mep1aP28825 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mep1aP28825 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mep1aP28825 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms