Protein–RNA interactions for Protein: Q61418

Clcn4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn4Q61418 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Clcn4Q61418 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clcn4Q61418 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clcn4Q61418 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Clcn4Q61418 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clcn4Q61418 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clcn4Q61418 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Clcn4Q61418 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Clcn4Q61418 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Clcn4Q61418 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clcn4Q61418 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clcn4Q61418 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clcn4Q61418 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clcn4Q61418 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clcn4Q61418 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clcn4Q61418 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clcn4Q61418 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clcn4Q61418 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clcn4Q61418 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn4Q61418 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Clcn4Q61418 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clcn4Q61418 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clcn4Q61418 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clcn4Q61418 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clcn4Q61418 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clcn4Q61418 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn4Q61418 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn4Q61418 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn4Q61418 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clcn4Q61418 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clcn4Q61418 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clcn4Q61418 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clcn4Q61418 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clcn4Q61418 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clcn4Q61418 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clcn4Q61418 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clcn4Q61418 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clcn4Q61418 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clcn4Q61418 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Clcn4Q61418 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clcn4Q61418 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn4Q61418 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn4Q61418 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clcn4Q61418 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn4Q61418 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn4Q61418 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clcn4Q61418 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clcn4Q61418 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clcn4Q61418 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clcn4Q61418 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn4Q61418 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn4Q61418 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn4Q61418 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clcn4Q61418 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clcn4Q61418 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clcn4Q61418 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clcn4Q61418 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Clcn4Q61418 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clcn4Q61418 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clcn4Q61418 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn4Q61418 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clcn4Q61418 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn4Q61418 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clcn4Q61418 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clcn4Q61418 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn4Q61418 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clcn4Q61418 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn4Q61418 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn4Q61418 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn4Q61418 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clcn4Q61418 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clcn4Q61418 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clcn4Q61418 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clcn4Q61418 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn4Q61418 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn4Q61418 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn4Q61418 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn4Q61418 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn4Q61418 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn4Q61418 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn4Q61418 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn4Q61418 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn4Q61418 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn4Q61418 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn4Q61418 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn4Q61418 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn4Q61418 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn4Q61418 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn4Q61418 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn4Q61418 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn4Q61418 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn4Q61418 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn4Q61418 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn4Q61418 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clcn4Q61418 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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