RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 C4AP0C0L4 1744 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC35A3-211ENST00000638876 KCNQ3O43525 872 aa28.76■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 NFE2L2Q16236 605 aa28.76■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 COL15A1P39059 1388 aa28.75■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 FKBP8Q14318 412 aa28.75■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 GRIN3BO60391 1043 aa28.74■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 NARFQ9UHQ1 456 aa28.74■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A087WZG4 1122 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SLC35A3-211ENST00000638876 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.69■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 TGFB2P61812 414 aa28.68■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 TM4SF1P30408 202 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 DDR1Q08345 913 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 A1BGP04217 495 aa28.66■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.65■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 USP16Q9Y5T5 823 aa28.65■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 RIPK4P57078 832 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC35A3-211ENST00000638876 CHD4Q14839 1912 aa28.63■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.63■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.63■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 NFIXQ14938 502 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 UTRNP46939 3433 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 A0A0G2JLW4 131 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 DPEP1P16444 411 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 RUNDC1Q96C34 613 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.59■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SLC35A3-211ENST00000638876 SERPINB2P05120 415 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 NEUROD2Q15784 382 aa28.55■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.54■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 BCS1LQ9Y276 419 aa28.54■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 CAMTA2O94983 1202 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 PIM2Q9P1W9 311 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC35A3-211ENST00000638876 NBPF26B4DH59 902 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 KCNA3P22001 575 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 NBPF15Q8N660 670 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 SCN7AQ01118 1682 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 SETDB2Q96T68 719 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 CHRNA5P30532 468 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.46■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.46■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.45■■■□□ 2.15
SLC35A3-211ENST00000638876 RGL2O15211 777 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 NPHP1O15259 732 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 ANP32CO43423 234 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 CNBD1Q8NA66 436 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 BCORQ6W2J9 1755 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 ERBB4Q15303 1308 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 NGEFQ8N5V2 710 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 H0YIN7 160 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 CHL1O00533 1208 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 APAF1O14727 1248 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SLC35A3-211ENST00000638876 PDE6BP35913 854 aa28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms