RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637304.1

ZEB2-241, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZEB2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2-241ENST00000637304 MYO1BO43795 1136 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 POLE3Q9NRF9 147 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 REREQ9P2R6 1566 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ABCA6Q8N139 1617 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 RAD50Q92878 1312 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 AMPHP49418 695 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TUBB2AQ13885 445 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 FAM186AA6NE01 2351 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TET3O43151 1660 aa6.73□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ABCC1P33527 1531 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 KIF11P52732 1056 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 GBP6Q6ZN66 633 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TDO2P48775 406 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 E2F5Q15329 346 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 BICD2Q8TD16 824 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 KRT83P78385 493 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 MRGBPQ9NV56 204 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.72□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 CFTRP13569 1480 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SCN9AQ15858 1988 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ZMYM3Q14202 1370 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 H0YHG0 523 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 TRIM5Q9C035 493 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 CASZ1Q86V15 1759 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 FERP16591 822 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 IRX4P78413 519 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 PPP2R5AQ15172 486 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
ZEB2-241ENST00000637304 ATL3Q6DD88 541 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 PTPRGP23470 1445 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 A0A0G2JS52 829 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ARID3AQ99856 593 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 NUP205Q92621 2012 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ATF3P18847 181 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 CCDC27Q2M243 656 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 FSD1Q9BTV5 496 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 SPC24Q8NBT2 197 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.71□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 AMPD3Q01432 767 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 PAX3P23760 479 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 GCC1Q96CN9 775 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 KIF2CQ99661 725 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 GAS8O95995 478 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 GSDMDP57764 484 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 SPC25Q9HBM1 224 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 ZSCAN12O43309 604 aa6.7□□□□□ -1.34
ZEB2-241ENST00000637304 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms