RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
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RABGEF1-209ENST00000607882 C4BP0C0L5 1744 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 NGEFQ8N5V2 710 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 NECTIN2Q92692 538 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 USP16Q9Y5T5 823 aa16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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RABGEF1-209ENST00000607882 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 CASZ1Q86V15 1759 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.33■□□□□ 0.21
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RABGEF1-209ENST00000607882 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RFC4P35249 363 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RUNDC1Q96C34 613 aa16.32■□□□□ 0.2
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RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.32■□□□□ 0.2
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RABGEF1-209ENST00000607882 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
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RABGEF1-209ENST00000607882 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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RABGEF1-209ENST00000607882 POLD1P28340 1107 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 MRC1P22897 1456 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6KA4O75676 772 aa16.3■□□□□ 0.2
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RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SSFA2P28290 1259 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 GYS1P13807 737 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 MYL6BP14649 208 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TJP1Q07157 1748 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM177BA6PVY3 158 aa16.27■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD3NLO95772 234 aa16.27■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 NBPF26B4DH59 902 aa16.25■□□□□ 0.19
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RABGEF1-209ENST00000607882 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 NBPF15Q8N660 670 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ZPR1O75312 459 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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RABGEF1-209ENST00000607882 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 COL15A1P39059 1388 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP5O75197 1615 aa16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1-209ENST00000607882 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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RABGEF1-209ENST00000607882 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.19■□□□□ 0.18
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