RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.27■■□□□ 1
EFTUD2-215ENST00000589825 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 NFE2L2Q16236 605 aa21.26■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIN3BO60391 1043 aa21.25■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 COL15A1P39059 1388 aa21.24■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.24■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A087WZG4 1122 aa21.24■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNQ3O43525 872 aa21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 FKBP8Q14318 412 aa21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 NARFQ9UHQ1 456 aa21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 CHD4Q14839 1912 aa21.23■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
EFTUD2-215ENST00000589825 TGFB2P61812 414 aa21.2■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 RIPK4P57078 832 aa21.19■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.19■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 A1BGP04217 495 aa21.18■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.18■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.18■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 USP16Q9Y5T5 823 aa21.17■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.16■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 TM4SF1P30408 202 aa21.16■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.16■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 DDR1Q08345 913 aa21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 NEUROD2Q15784 382 aa21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 RUNDC1Q96C34 613 aa21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.15■□□□□ 0.98
EFTUD2-215ENST00000589825 UTRNP46939 3433 aa21.14■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A0G2JLW4 131 aa21.14■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 NFIXQ14938 502 aa21.14■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.13■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.13■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.13■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.12■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.12■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.12■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 SERPINB2P05120 415 aa21.11■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 DPEP1P16444 411 aa21.11■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 BCS1LQ9Y276 419 aa21.11■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.1■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 NPHP1O15259 732 aa21.1■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 PIM2Q9P1W9 311 aa21.09■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.09■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.08■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 SETDB2Q96T68 719 aa21.08■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.08■□□□□ 0.97
EFTUD2-215ENST00000589825 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 ANP32CO43423 234 aa21.07■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 SCN7AQ01118 1682 aa21.07■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.07■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 CAMTA2O94983 1202 aa21.06■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.06■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.05■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 NBPF26B4DH59 902 aa21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNA5P30532 468 aa21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 NGEFQ8N5V2 710 aa21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 NBPF15Q8N660 670 aa21.04■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.03■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.03■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 H0YIN7 160 aa21.02■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 MYL6BP14649 208 aa21.02■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNA3P22001 575 aa21.02■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 BCORQ6W2J9 1755 aa21.02■□□□□ 0.96
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 PDE6BP35913 854 aa21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 ST5P78524 1137 aa21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 CNBD1Q8NA66 436 aa21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 APAF1O14727 1248 aa21■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 C2CD5Q86YS7 1000 aa21■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21■□□□□ 0.95
EFTUD2-215ENST00000589825 ERBB4Q15303 1308 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms