RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZPR1O75312 459 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFE2L2Q16236 605 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL15A1P39059 1388 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 C4AP0C0L4 1744 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 A1BGP04217 495 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDR1Q08345 913 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 NARFQ9UHQ1 456 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP16Q9Y5T5 823 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0G2JLW4 131 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRIN3BO60391 1043 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIPK4P57078 832 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFIXQ14938 502 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A087WZG4 1122 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 TM4SF1P30408 202 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEUROD2Q15784 382 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 TGFB2P61812 414 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 DPEP1P16444 411 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCS1LQ9Y276 419 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 RUNDC1Q96C34 613 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERPINB2P05120 415 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF26B4DH59 902 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHRNA5P30532 468 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF15Q8N660 670 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAMTA2O94983 1202 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 NGEFQ8N5V2 710 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNA3P22001 575 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC184Q52MB2 194 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-207ENST00000572043 UTRNP46939 3433 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIM2Q9P1W9 311 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYL6BP14649 208 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 SETDB2Q96T68 719 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPHP1O15259 732 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCN7AQ01118 1682 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 APAF1O14727 1248 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANP32CO43423 234 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 HLFQ16534 295 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 NECTIN2Q92692 538 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM177BA6PVY3 158 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT24Q2M2I5 525 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNBD1Q8NA66 436 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.26■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHD4Q14839 1912 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
CTDNEP1-207ENST00000572043 H0YIN7 160 aa23.24■■□□□ 1.31
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