RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.51■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.51■■■□□ 2
MEIS3-212ENST00000561293 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 GNPATO15228 680 aa27.5■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.5■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.49■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 AKT1S1Q96B36 256 aa27.49■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.49■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.48■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 AK7Q96M32 723 aa27.48■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.48■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 E9PSI1 815 aa27.47■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 C4BP0C0L5 1744 aa27.47■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 SLC15A2Q16348 729 aa27.46■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 PROSER3Q2NL68 480 aa27.46■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 MYL6BP14649 208 aa27.45■■□□□ 1.99
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF26B4DH59 902 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 STARD3NLO95772 234 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF14Q5TI25 921 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 NBPF15Q8N660 670 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 STK32BQ9NY57 414 aa27.45■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.43■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 MSH5O43196 834 aa27.42■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 ARXQ96QS3 562 aa27.42■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.41■■□□□ 1.98
MEIS3-212ENST00000561293 PDIA6Q15084 440 aa27.39■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 VAMP4O75379 141 aa27.38■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.38■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.38■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.37■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.36■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 RPS6KA4O75676 772 aa27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 MSL1Q68DK7 614 aa27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.34■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.33■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF428Q96B54 188 aa27.33■■□□□ 1.97
MEIS3-212ENST00000561293 COL15A1P39059 1388 aa27.32■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 ZBTB7AO95365 584 aa27.32■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.32■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.32■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.31■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 HOXB7P09629 217 aa27.31■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 G2E3Q7L622 706 aa27.3■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 SSFA2P28290 1259 aa27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 RFC4P35249 363 aa27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.29■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 SLC4A2P04920 1241 aa27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 COPS6Q7L5N1 327 aa27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
MEIS3-212ENST00000561293 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.26■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 HLFQ16534 295 aa27.24■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 STK31Q9BXU1 1019 aa27.24■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 FKBP8Q14318 412 aa27.24■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.24■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 C4AP0C0L4 1744 aa27.23■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.23■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 ZPR1O75312 459 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 BCAR3O75815 825 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 CAMTA2O94983 1202 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 GYS1P13807 737 aa27.22■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.2■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 ERBB4Q15303 1308 aa27.2■■□□□ 1.95
MEIS3-212ENST00000561293 ADRA2BP18089 450 aa27.2■■□□□ 1.94
MEIS3-212ENST00000561293 NARFQ9UHQ1 456 aa27.2■■□□□ 1.94
MEIS3-212ENST00000561293 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms