RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 RREB1Q92766 1687 aa24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 STARD3NLO95772 234 aa24.06■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 A1BGP04217 495 aa24.05■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 C4BP0C0L5 1744 aa24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.03■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF26B4DH59 902 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANXA1P04083 346 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF14Q5TI25 921 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF15Q8N660 670 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDIA6Q15084 440 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 PROSER3Q2NL68 480 aa24.01■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CANXP27824 592 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYL6BP14649 208 aa23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF428Q96B54 188 aa23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.98■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERBB4Q15303 1308 aa23.98■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF827Q17R98 1081 aa23.97■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM5Q71RC9 77 aa23.97■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 AK7Q96M32 723 aa23.97■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK31Q9BXU1 1019 aa23.97■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACNA1FO60840 1977 aa23.97■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNPATO15228 680 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC4A2P04920 1241 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKT1S1Q96B36 256 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.95■■□□□ 1.43
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.95■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPS6KA4O75676 772 aa23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCAR3O75815 825 aa23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 G2E3Q7L622 706 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 HYPKQ9NX55 129 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC15A2Q16348 729 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK32BQ9NY57 414 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHF14O94880 888 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 COPS6Q7L5N1 327 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL15A1P39059 1388 aa23.89■■□□□ 1.42
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 FLIIQ13045 1269 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARXQ96QS3 562 aa23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSFA2P28290 1259 aa23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 C4AP0C0L4 1744 aa23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOCS7O14512 581 aa23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A087WZG4 1122 aa23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADRA2BP18089 450 aa23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF16BQ96L93 1317 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.83■■□□□ 1.4
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFC4P35249 363 aa23.82■■□□□ 1.4
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.82■■□□□ 1.4
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms