RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.63■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.63■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.62■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 STARD3NLO95772 234 aa27.62■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 FKBP8Q14318 412 aa27.62■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.62■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 COL15A1P39059 1388 aa27.61■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.61■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.59■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 A1BGP04217 495 aa27.58■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.58■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 USP16Q9Y5T5 823 aa27.58■■■□□ 2.01
CS-226ENST00000551430 RIPK4P57078 832 aa27.57■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 DDR1Q08345 913 aa27.57■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.57■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
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CS-226ENST00000551430 NARFQ9UHQ1 456 aa27.56■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 ZPR1O75312 459 aa27.54■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 25e-10■□□□□ 9.3
CS-226ENST00000551430 GPR162Q16538 588 aa27.54■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.54■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 RUNDC1Q96C34 613 aa27.54■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 TM4SF1P30408 202 aa27.52■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.52■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.52■■■□□ 2
CS-226ENST00000551430 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 NEUROD2Q15784 382 aa27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.5■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 NFIXQ14938 502 aa27.49■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 NBPF26B4DH59 902 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 YY1P25490 414 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 NBPF15Q8N660 670 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.47■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 A0A087WZG4 1122 aa27.47■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.47■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.46■■□□□ 1.99
CS-226ENST00000551430 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.45■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 CAMTA2O94983 1202 aa27.44■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 SCN7AQ01118 1682 aa27.43■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 A0A0G2JLW4 131 aa27.43■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 TGFB2P61812 414 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 APAF1O14727 1248 aa27.41■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 DPEP1P16444 411 aa27.41■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 ANP32CO43423 234 aa27.4■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.4■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.4■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 KCNA3P22001 575 aa27.39■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.39■■□□□ 1.98
CS-226ENST00000551430 CHL1O00533 1208 aa27.38■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 GRIN3BO60391 1043 aa27.38■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 SERPINB2P05120 415 aa27.38■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.37■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.36■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 BCORQ6W2J9 1755 aa27.35■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 KRT24Q2M2I5 525 aa27.35■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 CHRNA5P30532 468 aa27.34■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 MRS2Q9HD23 443 aa27.34■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CS-226ENST00000551430 CHD4Q14839 1912 aa27.31■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 NGEFQ8N5V2 710 aa27.31■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 BCS1LQ9Y276 419 aa27.31■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 PDIA6Q15084 440 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 HLFQ16534 295 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.3■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 ZNF853P0CG23 659 aa27.29■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 MYL6BP14649 208 aa27.29■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 PROSER3Q2NL68 480 aa27.29■■□□□ 1.96
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CS-226ENST00000551430 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.29■■□□□ 1.96
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CS-226ENST00000551430 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CS-226ENST00000551430 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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