RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 MMP10P09238 476 aa23.48■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 BCORQ6W2J9 1755 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 STARD3NLO95772 234 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 CHD4Q14839 1912 aa23.46■■□□□ 1.35
CS-219ENST00000550655 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 FKBP8Q14318 412 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 UTRNP46939 3433 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 NARFQ9UHQ1 456 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 RIPK4P57078 832 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 RUNDC1Q96C34 613 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 USP16Q9Y5T5 823 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-219ENST00000550655 ZPR1O75312 459 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 A1BGP04217 495 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 DDR1Q08345 913 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 GPR162Q16538 588 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.335e-10■□□□□ 9.3
CS-219ENST00000550655 TM4SF1P30408 202 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 CCDC184Q52MB2 194 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 A0A087WZG4 1122 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 NFIXQ14938 502 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CS-219ENST00000550655 NBPF26B4DH59 902 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 YY1P25490 414 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 NEUROD2Q15784 382 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 NBPF15Q8N660 670 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 CAMTA2O94983 1202 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 TGFB2P61812 414 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 ANP32CO43423 234 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-219ENST00000550655 NUP98P52948 1817 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 A0A0G2JLW4 131 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 GRIN3BO60391 1043 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 APAF1O14727 1248 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 SERPINB2P05120 415 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 DPEP1P16444 411 aa23.25■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 CHL1O00533 1208 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 KCNA3P22001 575 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 MRS2Q9HD23 443 aa23.22■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 ERBB4Q15303 1308 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-219ENST00000550655 RGL2O15211 777 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 CHRNA5P30532 468 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 KRT24Q2M2I5 525 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 BCS1LQ9Y276 419 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 ZNF853P0CG23 659 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 MYL6BP14649 208 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-219ENST00000550655 CFAP44Q96MT7 982 aa23.17■■□□□ 1.3
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