RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123		M0R2N6	131 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	GPR25	O00155	361 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	EPHA4	P54764	986 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	GAS6	Q14393	721 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	SIX5	Q8N196	739 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	THBS1	P07996	1170 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	FOXK2	Q01167	660 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	RASA1	P20936	1047 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	TNS4	Q8IZW8	715 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TCTN1-222	ENST00000549123	DKK1	O94907	266 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TEAD4	Q15561	434 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	NES	P48681	1621 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP4A	P20648	1035 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	MX2	P20592	715 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	NOS2	P35228	1153 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	SEC13	P55735	322 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	IGF1R	P08069	1367 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	CFTR	P13569	1480 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	PTK7	Q13308	1070 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A1W2PNR3	127 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L21	D6R901	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	EML1	O00423	815 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	BNIP3L	O60238	219 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	TXLNA	P40222	546 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP2K3	P46734	347 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TCTN1-222	ENST00000549123	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TCTN1-222	ENST00000549123	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TCTN1-222	ENST00000549123	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TCTN1-222	ENST00000549123	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21

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