RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 SHPRHQ149N8 1683 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ST5P78524 1137 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF790Q6PG37 636 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-206ENST00000548122 TNS2Q63HR2 1409 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF428Q96B54 188 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 BCS1LQ9Y276 419 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 MTFR1LQ9H019 292 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 ATG3Q9NT62 314 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 CCER2I3L3R5 266 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 MMP10P09238 476 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 A1BGP04217 495 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 IL17REQ8NFR9 667 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SSFA2P28290 1259 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SLIT3O75094 1523 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 H0YIN7 160 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 RPS6KA4O75676 772 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 ANXA1P04083 346 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 E9PSI1 815 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 SLC4A2P04920 1241 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 PIK3C2AO00443 1686 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 SMIM5Q71RC9 77 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 IFT57Q9NWB7 429 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-206ENST00000548122 HYPKQ9NX55 129 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRB-206ENST00000548122 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 COPS6Q7L5N1 327 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP3Q96P20 1036 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 USP16Q9Y5T5 823 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MYD88Q99836 296 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 NFAT5O94916 1531 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 SERPINB2P05120 415 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 MS4A1P11836 297 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-206ENST00000548122 PDE6BP35913 854 aa6.89□□□□□ -1.31
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