RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	COL18A1	P39060	1754 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	PTGDR	Q13258	359 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	AKAP12	Q02952	1782 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0G2JS52	829 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	MYT1	Q01538	1121 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	PANK3	Q9H999	370 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	IP6K1	Q92551	441 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	COG3	Q96JB2	828 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	CRB1	P82279	1406 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	HOXC9	P31274	260 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MDM2-234	ENST00000546048	DISP2	A7MBM2	1401 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	SLC24A1	O60721	1099 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	RNF40	O75150	1001 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM37	O94972	964 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	MYOM1	P52179	1685 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	IFFO2	Q5TF58	517 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	KCNQ2	O43526	872 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	FAM161A	Q3B820	660 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	EYA1	Q99502	592 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	POLK	Q9UBT6	870 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	USP54	Q70EL1	1684 aa		7	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	FCHSD2	O94868	740 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	AMPH	P49418	695 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	PPP4C	P60510	307 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	DDB1	Q16531	1140 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	PEAK1	Q9H792	1746 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	RGPD5	Q99666	1765 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	GPR37	O15354	613 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC125	Q86Z20	511 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	MEGF6	O75095	1541 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	EXOC5	O00471	708 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	APBA3	O96018	575 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	IL2RB	P14784	551 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	INSR	P06213	1382 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MDM2-234	ENST00000546048	APLP1	P51693	650 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	ABCC6	O95255	1503 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	FLT4	P35916	1363 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	TNS2	Q63HR2	1409 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC37A3	O60309	1634 aa		6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms