RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 MMP10P09238 476 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 RFC4P35249 363 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNQ4P56696 695 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 ERBB4Q15303 1308 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.74□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNA3P22001 575 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 NUP98P52948 1817 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 STARD3NLO95772 234 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 MSL1Q68DK7 614 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 NUDCQ9Y266 331 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 KLHL34Q8N239 644 aa7.72□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.72□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 SNED1Q8TER0 1413 aa7.72□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 HSPA6P17066 643 aa7.71□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.71□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF790Q6PG37 636 aa7.71□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
ANKRD49-208ENST00000544253 PPP2R1AP30153 589 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 DDR1Q08345 913 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 FSTL1Q12841 308 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 SOGA3Q5TF21 947 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PIM2Q9P1W9 311 aa7.71□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PHF14O94880 888 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 STYK1Q6J9G0 422 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 APLP1P51693 650 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 IL17REQ8NFR9 667 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF3CO14782 793 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ZPR1O75312 459 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 RALBP1Q15311 655 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 LGR6Q9HBX8 967 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 CACNA1SQ13698 1873 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 TOMM70O94826 608 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 DPEP1P16444 411 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PDE6BP35913 854 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 FKBP8Q14318 412 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 LTBP1Q14766 1721 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 CAMTA2O94983 1202 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 TEFQ10587 303 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 NFIXQ14938 502 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 IFFO2Q5TF58 517 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF609O15014 1411 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 VPS33BQ9H267 617 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 SLX4Q8IY92 1834 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PSME4Q14997 1843 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 HOXB7P09629 217 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 PRKAR2BP31323 418 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 CACNA1FO60840 1977 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 SERPINB2P05120 415 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 HMOX1P09601 288 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 LMNB1P20700 586 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
ANKRD49-208ENST00000544253 BTBD11A6QL63 1104 aa7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 NFE2L2Q16236 605 aa7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 TTLL6Q8N841 843 aa7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 CNKSR1Q969H4 720 aa7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 LAMB1P07942 1786 aa7.64□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 CRY2Q49AN0 593 aa7.64□□□□□ -1.19
ANKRD49-208ENST00000544253 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms