RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 RUNDC1Q96C34 613 aa30.36■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.36■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa30.36■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 GPR162Q16538 588 aa30.34■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 PARP3Q9Y6F1 533 aa30.34■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 UBR2Q8IWV8 1755 aa30.33■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 A0A087WZG4 1122 aa30.33■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.33■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ME3-210ENST00000532471 ANP32CO43423 234 aa30.32■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.32■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.32■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 USPL1Q5W0Q7 1092 aa30.3■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 NARFQ9UHQ1 456 aa30.3■■■□□ 2.44
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ME3-210ENST00000532471 NEUROD2Q15784 382 aa30.29■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 COL15A1P39059 1388 aa30.28■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 FKBP8Q14318 412 aa30.28■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 USP16Q9Y5T5 823 aa30.28■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 A1BGP04217 495 aa30.27■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.26■■■□□ 2.44
ME3-210ENST00000532471 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.23■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.23■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.22■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 TM4SF1P30408 202 aa30.22■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 GRIN3BO60391 1043 aa30.21■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 C4AP0C0L4 1744 aa30.21■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 YY1P25490 414 aa30.2■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 TGFB2P61812 414 aa30.2■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.2■■■□□ 2.43
ME3-210ENST00000532471 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 DDR1Q08345 913 aa30.16■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 NFIXQ14938 502 aa30.16■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.16■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.15■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 APAF1O14727 1248 aa30.14■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 MRS2Q9HD23 443 aa30.14■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ME3-210ENST00000532471 CCDC184Q52MB2 194 aa30.13■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 BICDL1Q6ZP65 573 aa30.13■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 A0A0G2JLW4 131 aa30.11■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 SERPINB2P05120 415 aa30.11■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
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ME3-210ENST00000532471 NBPF15Q8N660 670 aa30.1■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 SETDB2Q96T68 719 aa30.1■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.1■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 C10orf71Q711Q0 1435 aa30.1■■■□□ 2.41
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ME3-210ENST00000532471 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.09■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.08■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.08■■■□□ 2.41
ME3-210ENST00000532471 DPEP1P16444 411 aa30.07■■■□□ 2.4
ME3-210ENST00000532471 WWC3Q9ULE0 1092 aa30.07■■■□□ 2.4
ME3-210ENST00000532471 RGL2O15211 777 aa30.05■■■□□ 2.4
ME3-210ENST00000532471 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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ME3-210ENST00000532471 NPHP1O15259 732 aa30.04■■■□□ 2.4
ME3-210ENST00000532471 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.04■■■□□ 2.4
ME3-210ENST00000532471 MYL6BP14649 208 aa30.03■■■□□ 2.4
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ME3-210ENST00000532471 CHRNA5P30532 468 aa29.97■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.97■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 CHD4Q14839 1912 aa29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 H0YIN7 160 aa29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 PDE6BP35913 854 aa29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 ST5P78524 1137 aa29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 CNBD1Q8NA66 436 aa29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.96■■■□□ 2.39
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