RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	IL16	Q14005	1332 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	GNPAT	O15228	680 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	A1BG	P04217	495 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM25-208	ENST00000530978	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	STARD3NL	O95772	234 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ANXA1	P04083	346 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978		E9PSI1	815 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	MYL6B	P14649	208 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	COL15A1	P39059	1388 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	SSFA2	P28290	1259 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ARX	Q96QS3	562 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	PDIA6	Q15084	440 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	VAMP4	O75379	141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	HOXB7	P09629	217 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	RFC4	P35249	363 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM25-208	ENST00000530978	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	ADRA2B	P18089	450 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	GYS1	P13807	737 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978		A0A087WZG4	1122 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	ZPR1	O75312	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	FKBP8	Q14318	412 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	G2E3	Q7L622	706 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM25-208	ENST00000530978	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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