RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 AIDAQ96BJ3 306 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 M0R2N6 131 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 WIPF1O43516 503 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 EPHA4P54764 986 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 DPYDQ12882 1025 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 PGBD3Q8N328 593 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 GMCL1Q96IK5 515 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 DKK1O94907 266 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 MSX1P28360 303 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 DBN1Q16643 649 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 TBCELQ5QJ74 424 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 FOXK2Q01167 660 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 RUBCNLQ9H714 662 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 HINFPQ9BQA5 517 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 GPR25O00155 361 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 NOS2P35228 1153 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 EFHC2Q5JST6 749 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 SCRIBQ14160 1630 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ATP4AP20648 1035 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 TEAD4Q15561 434 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 TRERF1Q96PN7 1200 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 SERTM1A2A2V5 107 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CRISPLD1Q9H336 500 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf115Q9H7X2 142 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRC-214ENST00000530727 TXLNAP40222 546 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 KRT76Q01546 638 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 EML1O00423 815 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 THBS1P07996 1170 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PNR3 127 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 C21orf2O43822 256 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 GAS6Q14393 721 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 PHF24Q9UPV7 400 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-214ENST00000530727 ATG7O95352 703 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP8Q86W28 1048 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ZIC5Q96T25 663 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 IGFBP4P22692 258 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 STK32AQ8WU08 396 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 MBIPQ9NS73 344 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 MX2P20592 715 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 POTEAQ6S8J7 498 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.94□□□□□ -1.3
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