RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.34■□□□□ 0.69
BRMS1-204ENST00000525127 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.33■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 ZPR1O75312 459 aa19.32■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.32■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 CHD4Q14839 1912 aa19.31■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 STARD3NLO95772 234 aa19.31■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF790Q6PG37 636 aa19.3■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 TJP1Q07157 1748 aa19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 TGFB2P61812 414 aa19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 NEUROD2Q15784 382 aa19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 MCM10Q7L590 875 aa19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.29■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 BTBD11A6QL63 1104 aa19.27■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 DCTN1Q14203 1278 aa19.27■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.27■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
BRMS1-204ENST00000525127 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 FKBP8Q14318 412 aa19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 WWC1Q8IX03 1113 aa19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 COL15A1P39059 1388 aa19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 A0A087WZG4 1122 aa19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 NARFQ9UHQ1 456 aa19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.25■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.24■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF521Q96K83 1311 aa19.24■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 C4AP0C0L4 1744 aa19.23■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 WDR63Q8IWG1 891 aa19.23■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 IL16Q14005 1332 aa19.23■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.22■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 A0A0G2JLW4 131 aa19.22■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.21■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 TM4SF1P30408 202 aa19.21■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 DDR1Q08345 913 aa19.21■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 BCS1LQ9Y276 419 aa19.21■□□□□ 0.67
BRMS1-204ENST00000525127 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF853P0CG23 659 aa19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 DPEP1P16444 411 aa19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 CFAP44Q96MT7 982 aa19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 IFT57Q9NWB7 429 aa19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 CHL1O00533 1208 aa19.19■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.18■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 GNAI1P63096 354 aa19.18■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 NFIXQ14938 502 aa19.18■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 PIM2Q9P1W9 311 aa19.18■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 KCNQ3O43525 872 aa19.17■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.16■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.16■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 A1BGP04217 495 aa19.15■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 SERPINB2P05120 415 aa19.15■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.15■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.15■□□□□ 0.66
BRMS1-204ENST00000525127 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.14■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.14■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.14■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 KCNA3P22001 575 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 GOLGA2Q08379 1002 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 USP16Q9Y5T5 823 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 ATP10DQ9P241 1426 aa19.13■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 MBIPQ9NS73 344 aa19.12■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 C1QTNF8P60827 252 aa19.11■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.11■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 ADCY9O60503 1353 aa19.1■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 E9PSI1 815 aa19.1■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 NPHP1O15259 732 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms