RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516582.1

RNU6-638P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 638, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-638P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-638P-201ENST00000516582 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-638P-201ENST00000516582 A0A1W2PRU2 124 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 PRR19A6NJB7 356 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 C20orf173Q96LM9 149 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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RNU6-638P-201ENST00000516582 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 RELTQ969Z4 430 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZIC5Q96T25 663 aa3.51□□□□□ -1.85
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RNU6-638P-201ENST00000516582 RAB15P59190 212 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 MTMR2Q13614 643 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 PRR12Q9ULL5 1215 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.5□□□□□ -1.85
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RNU6-638P-201ENST00000516582 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 GNPATO15228 680 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 MSX1P28360 303 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 NLRP3Q96P20 1036 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 CYLDQ9NQC7 956 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 MEGF11A6BM72 1044 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 NUTM1Q86Y26 1132 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 CRELD1Q96HD1 420 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 RAXQ9Y2V3 346 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-638P-201ENST00000516582 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa3.47□□□□□ -1.85
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RNU6-638P-201ENST00000516582 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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RNU6-638P-201ENST00000516582 RAP1GAPP47736 663 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 NFKB2Q00653 900 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 TNP2Q05952 138 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 MESP2Q0VG99 397 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 CRISPLD1Q9H336 500 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 CFAP99D6REC4 459 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 LILRB5O75023 590 aa3.45□□□□□ -1.86
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RNU6-638P-201ENST00000516582 SYT9Q86SS6 491 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 STOML1Q9UBI4 398 aa3.45□□□□□ -1.86
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RNU6-638P-201ENST00000516582 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 CLN3Q13286 438 aa3.44□□□□□ -1.86
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RNU6-638P-201ENST00000516582 NDUFV2P19404 249 aa3.43□□□□□ -1.86
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RNU6-638P-201ENST00000516582 FBXL18Q96ME1 805 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 CCDC39Q9UFE4 941 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 SIN3BO75182 1162 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 BORCS6Q96GS4 357 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-638P-201ENST00000516582 ADH7P40394 386 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 ILDR2Q71H61 639 aa3.4□□□□□ -1.87
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RNU6-638P-201ENST00000516582 KRTAP5-9P26371 169 aa3.39□□□□□ -1.87
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RNU6-638P-201ENST00000516582 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 STRN4Q9NRL3 753 aa3.39□□□□□ -1.87
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RNU6-638P-201ENST00000516582 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
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RNU6-638P-201ENST00000516582 PRNPP04156 253 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 RNF43Q68DV7 783 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZBTB33Q86T24 672 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 FBXO11Q86XK2 927 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 FAM168AQ92567 244 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 SYN1P17600 705 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 MSMPQ1L6U9 139 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 TMEM40Q8WWA1 233 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-638P-201ENST00000516582 MARK1Q9P0L2 795 aa3.36□□□□□ -1.87
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