RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515066.6

AP3S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 2

Gene AP3S1, Length 1,670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1-208ENST00000515066 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 TRIM37O94972 964 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 SIK1P57059 783 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 PDIA6Q15084 440 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 PROSER3Q2NL68 480 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 STK31Q9BXU1 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
AP3S1-208ENST00000515066 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.51■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 G2E3Q7L622 706 aa21.51■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.51■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 TNNQ9UQP3 1299 aa21.51■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ANXA1P04083 346 aa21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 TRIM27P14373 513 aa21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.49■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.49■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ITPK1Q13572 414 aa21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ERBB4Q15303 1308 aa21.48■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 NBPF26B4DH59 902 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 RLBP1P12271 317 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 ATP6V1AP38606 617 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 FLIIQ13045 1269 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 NBPF14Q5TI25 921 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 NBPF15Q8N660 670 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 A1BGP04217 495 aa21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 PTPRCP08575 1304 aa21.46■■□□□ 1.03
AP3S1-208ENST00000515066 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 STARD3NLO95772 234 aa21.45■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 PDE3AQ14432 1141 aa21.45■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 KCNQ4P56696 695 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 PANK1Q8TE04 598 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 HYPKQ9NX55 129 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.44■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 ABCC4O15439 1325 aa21.43■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 MYL6BP14649 208 aa21.43■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 NEFLP07196 543 aa21.42■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.42■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.42■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 C4BP0C0L5 1744 aa21.42■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 FKBP8Q14318 412 aa21.41■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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AP3S1-208ENST00000515066 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.4■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 ADCY9O60503 1353 aa21.4■■□□□ 1.02
AP3S1-208ENST00000515066 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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AP3S1-208ENST00000515066 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.39■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 CRBNQ96SW2 442 aa21.39■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.39■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.39■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.38■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 PLSCR1O15162 318 aa21.38■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 COPS6Q7L5N1 327 aa21.38■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 PROM2Q8N271 834 aa21.38■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.38■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 APBA3O96018 575 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 MS4A1P11836 297 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 COG6Q9Y2V7 657 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.37■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 NUP98P52948 1817 aa21.36■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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AP3S1-208ENST00000515066 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.35■■□□□ 1.01
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AP3S1-208ENST00000515066 BCORQ6W2J9 1755 aa21.35■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 C4AP0C0L4 1744 aa21.35■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 KSR2Q6VAB6 950 aa21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
AP3S1-208ENST00000515066 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.34■■□□□ 1.01
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